野尻湖畔的聖奧斯拉修道院發生了兇殺案。一名女學生從「尼僧之塔」墜落死亡，其上半身有多數傷痕。兇案發生後的隔年五月，修道院附近山下的垂枝櫻樹下，倒掛著一具赤裸卻無頭顱的神父屍體。原本，二階堂蘭子與黎人受修道院長之託，前來協助搜查。然而隨著滿是暗號的紙條、深夜的異常儀式、收藏珍貴宗教書籍的地下圖書室等大量的證據相繼出現，讓蘭子、黎人與修道院再次搭上通往地獄的死亡列車……